DNA, uniwersalna, specyficzna i stabilna cząsteczka, odgrywa kluczową rolę w kontrolowaniu społeczności drobnoustrojów podczas procesu produkcji. Ma również zasadnicze znaczenie dla zapewnienia autentyczności surowców i zwalczania oszustw związanych z żywnością, a także wykrywania nieoczekiwanych zanieczyszczeń.
Techniki NGS nie tylko sekwencjonują genomy poszczególnych mikroorganizmów, ale także badają mieszane społeczności drobnoustrojów w żywności oraz definiują gatunki roślin i zwierząt obecne w surowcach i produktach spożywczych. Analiza NGS ma zastosowanie do różnych produktów spożywczych, przetworzonych próbek żywności i środowisk produkcyjnych.
Zalety Metabarkodingu DNA
Metabarcoding DNA sekwencjonuje markery genetyczne dostarczające informacji taksonomicznych, w połączeniu z nowymi technologiami NGS. Pozwala to na szybki, opłacalny, kompleksowy, powtarzalny i wiarygodny pomiar bioróżnorodności. Metabarcoding znajduje rozwiązania dla wszystkich gatunków obecnych w próbce, pokazując reprezentatywność każdego gatunku DNA w całkowitym DNA. Jest to metoda nieukierunkowana, korzystna w zapobieganiu oszustwom żywnościowym, identyfikacji nieoczekiwanych zanieczyszczeń bez dedykowanej metody oraz zachowaniu bezpieczeństwa i jakości żywności.
Metabarcoding DNA na Gatunkach Warzyw
Analiza metabarakodowania DNA warzyw ma kluczowe znaczenie, ponieważ surowce pochodzenia roślinnego są często fałszowane. Metasekwencjonowanie DNA ocenia autentyczność surowców, składników i suplementów diety, pomagając w zwalczaniu oszustw związanych z żywnością.
Obszary zainteresowania obejmują zioła, przyprawy, suplementy diety, zioła lecznicze i żywność ze składnikami roślinnymi, które mogą ulegać zanieczyszczeniu krzyżowemu lub produkcyjnemu. Analiza ta identyfikuje oszustwa, takie jak błędne etykietowanie, fałszywa deklaracja pochodzenia, znacząco wpływając na jakość produktów spożywczych i zarządzanie bezpieczeństwem.
Metabarcoding DNA na Gatunkach Zwierząt
Metabarcoding DNA identyfikuje DNA gatunków zwierząt. Podczas gdy ukierunkowana analiza DNA (np. qPCR lub ddPCR) odnosi się do konkretnych kwestii związanych ze znanymi gatunkami, metabarcoding przesiewa wiele regionów genomowych jednocześnie, identyfikując wszystkie obecne składniki. W przypadku mleka określa reprezentatywność gatunków (mleko krowie, bawole, kozie lub owcze), zapobiegając oszustwom. W przypadku ryb i produktów rybnych wykrywa powszechne oszustwa, takie jak nieprawidłowe etykietowanie, ryby hodowlane sprzedawane jako złowione, rozmrożone ryby sprzedawane jako świeże i fałszywe deklaracje pochodzenia. Jest to również ważne w przypadku mięsa, karmy dla zwierząt domowych i paszy dla zwierząt.
Metabarkodowanie DNA gatunków drobnoustrojów
Masowe sekwencjonowanie DNA w mikrobiologii środowiskowej oferuje kompleksowy obraz globalnej dynamiki populacji drobnoustrojów w zakładach produkcyjnych i ekosystemach. Technika ta koncentruje się na badaniu zidentyfikowanych populacji drobnoustrojów, idealnych do badania zanieczyszczeń, analizy okresu przydatności do spożycia i monitorowania środowiska.
Pochodzenie patogennych mikroorganizmów lub zanieczyszczeń wykrytych podczas przetwarzania jest często nieznane. Metabarcoding, dzięki podejściu Sequencing food factory, zapewnia lepsze zrozumienie ekologii drobnoustrojów i roli mikroorganizmów w łańcuchu żywnościowym. W porównaniu z tradycyjnymi metodami, analiza bioróżnorodności drobnoustrojów oparta na NGS (metagenomika 16S) obejmuje:
- Identyfikację tysięcy mikroorganizmów w pojedynczej analizie
- Identyfikację mikroorganizmów, których nie można hodować
- Możliwość określenia względnej liczebności różnych populacji
- Szybkie badanie złożonych ekosystemów
- Lepszą wiedzę i zdolność do kontrolowania flory drobnoustrojów
- Minimalizację zanieczyszczeń poprzez poprawę procedur higienicznych w zakładach produkcji żywności.
Metabarcoding wskazuje na etapy produkcji lub obszary zakładu wymagające poprawy higieny, umożliwia ocenę wpływu przechowywania żywności na wzrost bakterii powodujących psucie się żywności, ułatwiając odpowiedni dobór produkcji. Fabryka żywności, mikrobiologiczny ekosystem (Smart Microbial Ecosystem of Food Factory: SMEFF), umożliwia identyfikację społeczności drobnoustrojów lub miejsc skażenia, stale je monitorując. Ułatwia to ukierunkowane interwencje w zakresie sprzętu, projektowania przepływu pracy i praktyk higienicznych, znacznie poprawiając jakość produktu końcowego i okres przydatności do spożycia, jednocześnie zmniejszając szkodliwe dla środowiska koszty czyszczenia i produkcji. Rutynowe monitorowanie mikrobioty w zakładach przetwórstwa spożywczego umożliwia stosowanie bezpieczniejszych, wydajniejszych i zrównoważonych praktyk produkcyjnych.
Metabarkodowanie DNA w Mérieux NutriSciences: Od Próbki do Raportu Końcowego
Nasze laboratoria wykonują ekstrakcję kwasów nukleinowych, zapewniając wsparcie bezpośrednio z surowców.
- Ekstrakcja DNA z próbek
- Konstrukcja biblioteki metabarcodingu dla docelowych grup taksonomicznych
- Sekwencjonowanie za pomocą Illumina® MiSeq®
- Bioinformatyczna analiza danych sekwencjonowania
- Szczegółowy raport z tabelami i wykresami podsumowującymi informacje o próbce i kompletną metodę.
Usługi sekwencjonowania są zgodne z normami ISO 9001 i zaleceniami doświadczonych specjalistów.
Nasza sieć wykwalifikowanych laboratoriów wspiera projekty i testy, od zaprojektowania badania po raport końcowy. Dostosowujemy wszystko, aby spełnić Twoje potrzeby, od techniki biomolekularnej po analizę bioinformatyczną i przechowywanie danych. Mérieux NutriSciences oferuje analizy i doradztwo naukowe, dodając wartość do złożonych wyników sekwencjonowania, w szczególności do praktycznego zastosowania, zwiększając bezpieczeństwo i jakość żywności.
