NGS, Yeni Nesil Dizileme (Next Generation Sequencing) Tekni\u011fi, milyonlarca par\u00e7aya ayr\u0131lm\u0131\u015f bir DNA molek\u00fcl\u00fcn\u00fcn her bir par\u00e7as\u0131n\u0131n ayn\u0131 anda, uyum i\u00e7erisinde, paralel olarak y\u00fcksek bir verimle i\u015flenmesini temel al\u0131r. Yeni nesil dizileme s\u00fcreci; DNA’y\u0131 birden fazla par\u00e7aya ay\u0131rmay\u0131, adapt\u00f6rler eklemeyi, kitapl\u0131klar\u0131 dizilemeyi ve bir genomik dizi olu\u015fturmak i\u00e7in yeniden birle\u015ftirmeyi i\u00e7ermektedir. NGS – Yeni Nesil Dizileme Tekni\u011fi olarak; WGS (T\u00fcm Genom Dizileme – Whole Genom Sequencing) ve Metagenomik (Metadizileme) yakla\u015f\u0131mlar\u0131 kullan\u0131lmaktad\u0131r.<\/p>\n\n\n\n
WGS (Whole Genom Sequencing) – T\u00fcm Genom Dizileme<\/strong><\/p>\n\n\n\n WGS, bir canl\u0131 organizman\u0131n DNA’s\u0131nda bulunan t\u00fcm n\u00fckleotidlerin s\u0131ras\u0131n\u0131 belirleyip, bu s\u0131ray\u0131 bilinen referans genomlarla kar\u015f\u0131la\u015ft\u0131rmak suretiyle bu organizman\u0131n tan\u0131mlanabilmesini sa\u011flayan bir dizileme tekni\u011fidir. Bu metot sayesinde \u00f6zellikle g\u0131da zehirlenmelerinde hastal\u0131\u011fa yol a\u00e7an mikrobiyolojik etkenlerin su\u015f karakterizasyonu kolayl\u0131kla yap\u0131labilmektedir. Bu y\u00f6ntemde saf izole bakteri kullan\u0131l\u0131r, bakterinin t\u00fcm alt tiplemesi ile birlikte virulomu ve rezistomu da ortaya \u00e7\u0131kar\u0131labilmektedir. <\/p>\n\n\n\n WGS y\u00f6ntemi ayn\u0131 zamanda fermente \u00fcr\u00fcnlerin \u00fcretiminde kullan\u0131lan bakteri k\u00fclt\u00fcrlerine ait genlerin \u00fcr\u00fcn\u00fcn tad\u0131 ve kalitesi ile olan ili\u015fkisinin anla\u015f\u0131lmas\u0131nda da kullan\u0131lan \u00e7ok \u00f6nemli bir tekniktir. WGS, \u00fcretim tesislerinin mikrobiyolojik \u00e7evresel izleme programlar\u0131nda \u00f6zellikle diren\u00e7li su\u015flar\u0131n belirlenmesinde de kullan\u0131lmaktad\u0131r. <\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n Metagenomik – Metadizileme<\/strong><\/p>\n\n\n\n Bir ortamda bulunan kar\u0131\u015f\u0131k bir pop\u00fclasyona ait t\u00fcm genetik materyalin (metagenom) ayn\u0131 anda ve birbirine paralel olarak dizileyip, ortamda bulunan t\u00fcm organizmalar\u0131n tan\u0131mlanabilmesini sa\u011flayan y\u00fcksek \u00e7\u0131kt\u0131l\u0131 bir tekniktir. Burada t\u00fcm metagenom analiz edildi\u011fi i\u00e7in bu tekni\u011fe ayn\u0131 zamanda metabarcoding de denilmektedir. Bu teknikle bir kompleks mikroorganizma toplulu\u011funda bulunan t\u00fcm bakterilerin ve mantarlar\u0131n ayn\u0131 anda tan\u0131mlanabilmesi yap\u0131labilece\u011fi gibi, bir baharat kar\u0131\u015f\u0131m\u0131 veya bitkisel g\u0131da takviyesinin i\u00e7erisinde bulunan t\u00fcm bitkiler de belirlenebilmektedir. G\u0131dalarda bozulmaya yol a\u00e7an floran\u0131n ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131, \u00fcr\u00fcn geli\u015ftirme ve raf \u00f6mr\u00fc \u00e7al\u0131\u015fmalar\u0131 metadizilemenin kullan\u0131ld\u0131\u011f\u0131 ba\u015fka \u00f6rnek uygulamalard\u0131r.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" NGS, Yeni Nesil Dizileme (Next Generation Sequencing) Tekni\u011fi, milyonlarca par\u00e7aya ayr\u0131lm\u0131\u015f bir DNA molek\u00fcl\u00fcn\u00fcn her bir par\u00e7as\u0131n\u0131n ayn\u0131 anda, uyum i\u00e7erisinde, paralel olarak y\u00fcksek bir verimle i\u015flenmesini temel al\u0131r. Yeni nesil dizileme s\u00fcreci; DNA’y\u0131 birden fazla par\u00e7aya ay\u0131rmay\u0131, adapt\u00f6rler eklemeyi, kitapl\u0131klar\u0131 dizilemeyi ve bir genomik dizi olu\u015fturmak i\u00e7in yeniden birle\u015ftirmeyi i\u00e7ermektedir. NGS – Yeni Nesil Dizileme Tekni\u011fi olarak; WGS…<\/p>\n","protected":false},"author":53,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"_kad_blocks_custom_css":"","_kad_blocks_head_custom_js":"","_kad_blocks_body_custom_js":"","_kad_blocks_footer_custom_js":"","_kad_post_transparent":"","_kad_post_title":"","_kad_post_layout":"","_kad_post_sidebar_id":"","_kad_post_content_style":"","_kad_post_vertical_padding":"","_kad_post_feature":"","_kad_post_feature_position":"","_kad_post_header":false,"_kad_post_footer":false,"_kad_post_classname":"","footnotes":""},"folder":[],"class_list":["post-157589","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"taxonomy_info":[],"featured_image_src_large":false,"author_info":{"display_name":"darko","author_link":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/author\/darko-tapollostudio-fr\/"},"comment_info":0,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/157589","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/53"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=157589"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/157589\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":157590,"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/157589\/revisions\/157590"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=157589"}],"wp:term":[{"taxonomy":"folder","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/tr\/wp-json\/wp\/v2\/folder?post=157589"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}