{"id":14455,"date":"2022-02-18T16:17:53","date_gmt":"2022-02-18T16:17:53","guid":{"rendered":"https:\/\/test.merieuxnutrisciences.com\/?page_id=14455"},"modified":"2024-01-29T14:56:05","modified_gmt":"2024-01-29T14:56:05","slug":"il-servizio-di-metabarcoding-del-dna-by-merieux-nutrisciences","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.merieuxnutrisciences.com\/it\/food\/servizi\/servizi-per-la-gestione-delle-frodi-e-autenticita-alimentare\/il-servizio-di-metabarcoding-del-dna-by-merieux-nutrisciences\/","title":{"rendered":"Il servizio di Metabarcoding del DNA by M\u00e9rieux NutriSciences"},"content":{"rendered":"\n

Oltre al sequenziamento dei genomi dei singoli microrganismi, le tecniche NGS<\/strong> possono essere utilizzate per lo studio delle comunit\u00e0 microbiche miste presenti negli alimenti e per la definizione delle specie vegetali e animali presenti nelle materie prime e prodotti alimentari<\/strong>. L\u2019analisi con l\u2019NGS pu\u00f2 essere applicata a moltissimi alimenti, a campioni alimentari trasformati e all\u2019ambiente di produzione.  
Il DNA \u00e8 una molecola universale, specifica e stabile. Per questo, l’analisi di DNA \u00e8 diventata lo strumento analitico pi\u00f9 importante non solo per il controllo dello sviluppo delle comunit\u00e0 microbiche <\/strong>durante il processo produttivo, ma anche nell\u2019ambito dell\u2019autenticit\u00e0 delle materie prime, <\/strong>nella lotta alle frodi alimentari<\/strong> e per riconoscere l\u2019eventuale presenza di contaminazioni indesiderate.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Quali sono i vantaggi del DNA Metabarcoding?<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Il metabarcoding del DNA \u00e8 il sequenziamento di marker genetici che forniscono informazioni tassonomiche accoppiato alle nuove tecnologie di NGS; ci\u00f2 fa s\u00ec che la biodiversit\u00e0 sia misurata in modo rapido, economico, omnicomprensivo, ripetibile e affidabile<\/strong>. L\u2019applicazione del metabarcoding permette di avere una soluzione con tutte le specie presenti nel campione analizzato e un\u2019idea della rappresentativit\u00e0 di ogni specie di DNA nel DNA totale. 
Il sequenziamento con metabarcoding \u00e8 untargeted<\/strong> ed \u00e8 un vantaggio nella prevenzione di<\/strong> frodi alimentari<\/strong>, nel determinare eventuali contaminazioni indesiderate<\/strong> senza sviluppare un metodo dedicato, nel preservare la sicurezza e la qualit\u00e0 dei prodotti alimentari<\/strong>. <\/p>\n\n\n\n

DNA Metabarcoding su specie vegetali<\/h3>\n\n\n\n

L\u2019applicazione del metabarcoding sul DNA di specie vegetali<\/strong> risulta essere importante proprio perch\u00e9 le materie prime di origine vegetale sono tra le pi\u00f9 adulterate. 
L\u2019analisi di metasequenziamento del DNA permette di valutare l\u2019autenticit\u00e0 delle materie prime e ingredienti e di integratori alimentari<\/strong> contribuendo alla lotta contro le frodi alimentari. 
In particolare, il focus riguarda: <\/p>\n\n\n\n

    \n
  • Erbe e spezie:<\/strong> questi alimenti sono caratterizzati da una filiera molto frammentata ed essendo sfusi sono facilmente sostituibili, quindi soggetti ad adulterazione<\/strong>.<\/li>\n\n\n\n
  • Integratori alimentari ed erbe officinali:<\/strong> di queste materie prime \u00e8 importante valutare l\u2019autenticit\u00e0 degli estratti<\/li>\n\n\n\n
  • Alimenti con ingredienti vegetali<\/strong>: possono essere soggetti a contaminazione crociata<\/strong> anche da altre piante potenzialmente tossiche<\/strong>; per tale motivo, lo screening degli ingredienti pu\u00f2 prevenirne l\u2019occorrenza. \u00c8 oltretutto possibile anche una contaminazione in fase di processo produttivo. <\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n

    L\u2019applicazione del DNA metabarcoding identifica possibili frodi tra cui errata<\/strong> dichiarazione in etichetta e false dichiarazioni di origine<\/strong> e ha un impatto significativo sulla gestione della qualit\u00e0 e della sicurezza dei prodotti alimentari. <\/strong><\/p>\n\n\n\n

    DNA Metabarcoding su specie animali<\/h3>\n\n\n\n

    Il metasequenziamento del DNA pu\u00f2 essere applicato anche per l\u2019identificazione di DNA di specie animali<\/strong>. Le analisi targeted del DNA (tra cui qPCR o ddPCR) possono risolvere problemi specifici legati alla presenza o assenza di specie note, mentre il metabarcoding permette di fare uno screening di pi\u00f9 regioni genomiche contemporaneamente<\/strong>, identificando tutti gli ingredienti presenti nel prodotto alimentare.
    Per quanto riguarda le specie animali l\u2019applicazione del metabarcoding del DNA \u00e8 di rilevante importanza per matrici quali:<\/p>\n\n\n\n

      \n
    • Latte<\/strong>: al fine di prevenire frodi in quanto il latte \u00e8 un alimento altamente adulterato e la tecnica analitica basata sul metasequenziamento permette di determinare una percentuale di rappresentativit\u00e0 delle specie presenti nel campione (latte vaccino, bufalino, caprino o ovino)<\/li>\n\n\n\n
    • Pesce e prodotti ittici:<\/strong> anche il pesce \u00e8 tra i prodotti alimentari maggiormente adulterati. Tra le frodi pi\u00f9 comuni: etichettatura errata<\/strong>, pesce d\u2019allevamento venduto come pescato, pesce scongelato venduto come fresco<\/strong> e dichiarazioni di origine. <\/li>\n\n\n\n
    • Carne<\/strong><\/li>\n\n\n\n
    • Pet food<\/strong><\/li>\n\n\n\n
    • Mangimi per animali<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n

       DNA Metabarcoding su specie microbiche<\/h3>\n\n\n\n

      L\u2019applicazione delle tecniche di sequenziamento massivo del DNA agli studi di microbiologia ambientale<\/strong> offre una visione completa delle dinamiche globali della popolazione microbica nei siti produttivi cos\u00ec come degli ecosistemi microbici.<\/strong> In questo caso, il potenziale applicativo \u00e8 focalizzato sull\u2019indagine delle popolazioni microbiche identificate, rendendo tale analisi perfetta per indagini di contaminazione<\/strong>, analisi di shelf life <\/strong>e monitoraggio ambientale<\/strong>.
      Le origini dei microrganismi patogeni o contaminanti rilevati nei processi di trasformazione sono molto spesso sconosciute. Attraverso il \u201cSequencing food factory approach<\/em>\u201d (sequenziamento globale di tutte le componenti che influenzano microbiologicamente il processo produttivo quali: aria, ambiente, acqua, mani dell\u2019operatore, materie prime, prodotti intermedi, ecc.), il metabarcoding<\/strong> consente una maggiore comprensione del ruolo globale dell\u2019ecologia microbica e dei microrganismi in generale lungo la catena alimentare.<\/strong> <\/p>\n\n\n\n

      Rispetto ai metodi tradizionali, i vantaggi dell\u2019analisi della biodiversit\u00e0 microbica (metagenomica 16S) basata sull\u2019NGS comprendono:<\/strong><\/p>\n\n\n\n

        \n
      • Identificazione di migliaia di microorganismi in una singola analisi<\/li>\n\n\n\n
      • Identificazione di microrganismi non coltivabili<\/li>\n\n\n\n
      • Possibilit\u00e0 di determinare l\u2019abbondanza relativa delle diverse popolazioni<\/li>\n\n\n\n
      • Screening rapido di ecosistemi complessi<\/li>\n\n\n\n
      • Migliore conoscenza e maggiore capacit\u00e0 di controllo della flora microbica<\/li>\n\n\n\n
      • Minimizzazione degli eventi di inquinamento da microrganismi alteranti grazie al miglioramento delle procedure di igiene negli stabilimenti di produzione alimentare <\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n

        Il metabarcoding pu\u00f2 quindi essere utilizzato per evidenziare le fasi del processo di produzione o le aree dello stabilimento in cui si richiede un miglioramento delle pratiche igieniche<\/strong>, oltre che per valutare l\u2019impatto delle procedure di conservazione degli alimenti sulla crescita di batteri alteranti, agevolando la scelta di quelle pi\u00f9 adatte a ogni tipologia di produzione<\/strong>.
        Lo stabilimento alimentare pu\u00f2 essere visto come un ecosistema microbico <\/strong>(Smart Microbial Ecosystem of Food Factory<\/em>, SMEFF) in cui \u00e8 possibile identificare le comunit\u00e0 microbiche o i siti di contaminazione e tenerli costantemente monitorati. Ci\u00f2 consente degli interventi mirati sulle attrezzature, sulla progettazione dei flussi di lavoro e sulle pratiche igieniche<\/strong>. Applicando questo nuovo concetto di SMEFF, la qualit\u00e0 e la shelf life del prodotto finale migliorano in maniera significativa, riducono gli interventi di pulizia dannosi per l\u2019ambiente e i costi di produzione. Negli stabilimenti di trasformazione degli alimenti, il monitoraggio di routine del microbiota consente di attuare pratiche produttive pi\u00f9 sicure, efficienti e sostenibili.<\/p>\n\n\n\n

        DNA metabarcoding @ M\u00e9rieux NutriSciences: dal campione al report finale<\/h3>\n\n\n\n
        \"\"<\/figure>\n\n\n\n

        L\u2019estrazione dell\u2019acido nucleico \u00e8 generalmente eseguita presso i nostri laboratori per offrire supporto ai clienti partendo direttamente dalla materia prima.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

          \n
        • Estrazione del DNA dai campioni<\/li>\n\n\n\n
        • Costruzione della libreria del metabarcoding per i gruppi tassonomici target<\/li>\n\n\n\n
        • Sequenziamento con Illumina\u00ae MiSeq\u00ae<\/li>\n\n\n\n
        • Analisi bioinformatica dei dati di sequenziamento <\/li>\n\n\n\n
        • Report scientifico dettagliato con tabelle e grafici che riassumono le informazioni dei diversi campioni e del metodo completo<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n

          Gli standard di qualit\u00e0 applicati ai servizi di sequenziamento sono conformi agli standard ISO 9001 <\/strong>e rispettano le raccomandazioni di professionisti esperti.
          La nostra rete di laboratori qualificati \u00e8 in grado di supportare i progetti e i test del cliente, dalla progettazione dello studio fino al report finale<\/strong>. Tutto \u00e8 adattato per soddisfare le vostre necessit\u00e0, dalla tecnica biomolecolare all\u2019analisi bioinformatica, fino alla conservazione dei dati. M\u00e9rieux NutriSciences offre analisi e consulenza scientifica per dare valore aggiunto ai complessi risultati del sequenziamento, in particolare per la loro applicazione pratica e per aumentare la sicurezza e la qualit\u00e0 alimentare.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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