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Biofortis Microbiota - Plataforma NGS

Uno de los avances más revolucionarios en el área de las ciencias de la vida en estos últimos años ha sido el descubrimiento de que el ser humano vive de manera simbiótica con varias comunidades microbianas. Actualmente está particularmente bien documentado que estas comunidades tienen un papel central en múltiples patologías humanas y más ampliamente en la salud humana.

Para responder a la creciente demanda de estudiar los mecanismos de interacción entre estas floras bacterianas y su medio ambiente y cómo la microflora impacta las funciones biológicas, Biofortis ofrece servicios completos de seguimiento de microbiota en varias áreas: intestinal, piel y salud oral.

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La plataforma de microbiota de Biofortis incluye:

  • Reclutamiento de voluntarios
  • Preparación y almacenamiento de muestras (biobanking)
  • Microbiología
  • Metagenómica dirigida y WGS
  • Tipado de cepas
  • Cuantificación bacteriana
  • Evaluación de fármacos, probióticos, prebióticos, simbióticos, nutracéuticos, efectos de los alimentos, ...
  • Bioestadística y metodología

Nuestros experimentados científicos a cargo de esta plataforma están continuamente involucrados en proyectos de colaboración público-privada y programas de investigación transnacionales.

Con el aumento de la incidencia de enfermedades metabólicas inflamatorias crónicas, la forma en que la dieta, los probióticos, los complementos alimentarios... impactan en la salud es de gran preocupación. Paralelamente, también es necesario elucidar la cuestión de la "nutrición personalizada", relacionada con la variabilidad de la respuesta a una dieta determinada, o tratamiento. Además de las características genéticas, uno de los principales determinantes de la salud humana es el microbioma intestinal.

El desequilibrio de la microbiota tiene graves consecuencias en la ingesta energética de la dieta (obesidad), procesos inflamatorios y función inmune del huésped. Es por eso que tener en cuenta las características de la microbiota intestinal ayudará a definir su impacto y las interacciones con el huésped, producto, terapia, enfermedad y definir la nutrición personalizada.

Con más de 1 mil artículos científicos publicados cada año en todo el mundo y la proliferación de proyectos de microbioma humano, el estudio de microbiota intestinal es uno de los campos más prometedores en la investigación de salud en este siglo, especialmente por la mejora tecnológica de las herramientas de investigación. 

Nuestra piel está permanentemente protegida por microorganismos para defenderse contra patógenos y contribuir a la integridad de la piel. Este ecosistema beneficioso se llama microbiota de la piel (flora).

Las modificaciones del equilibrio de la flora de la piel pueden afectar gravemente la salud de la piel y pueden provocar trastornos de la piel (deshidratación, piel grasa, envejecimiento...) o enfermedades de la piel (dermatitis, acné...).

De manera similar, el desequilibrio microbiano de la piel puede causar trastornos cutáneos (dermatitis, acné...). Frente a nuestros estilos de vida (nutrición, medio ambiente), la medicación y la exposición de nuestro cuerpo a los factores estresantes cotidianos (contaminación, UV, humo, cosméticos ...), la nueva generación de productos se desarrollan ahora para respetar mejor esta protección natural que es nuestra microbiota.

Esquema

  • Procesamiento de secuencias
  • Control de calidad de lecturas
  • Asignaciones taxonómicas
  • Agrupaciones - Clustering

Teniendo en cuenta numerosas similitudes en términos de genética y fisiología entre animales y seres humanos, modelos animales, especialmente murinos-roedores, son ampliamente utilizados en la investigación de microbiomas.

En estos últimos años Biofortis ha participado en varios estudios sobre animales para evaluar el papel y el funcionamiento de la microbiota intestinal y su asociación con enfermedades:

  • Impacto de la nutrición específica en la microbiota intestinal
  • Pruebas preclínicas de tratamiento alternativo a la antibioterapia
  • Efecto de la quimioterapia en el modelo PDX

Como uno de los socios originales de este consorcio, Biofortis Mérieux NutriSciences aporta su experiencia en la gestión de ensayos clínicos y su conocimiento científico en la investigación de microbiota.

El primer objetivo es coordinar el estudio clínico de 7 centros clínicos franceses, para el reclutamiento de pacientes que presentan varios tipos de cáncer: mama, ovario, hígado y próstata. Se generará un biobanco de heces y sangre asociado con la información médica del paciente, clínicamente caracterizado y estandarizado para el proveedor de bioespecímenes.

El segundo papel es explorar la relación entre la microbiota del intestino y el cáncer, e identificar el impacto del tratamiento farmacológico en la microbiota de pacientes y de modelos de PDX. Este estudio longitudinal de microbiota se realiza antes y después de la quimioterapia. El objetivo principal es identificar "biomarcadores de microbiota" para la investigación del cáncer.

Este proyecto ayudará a comprender mejor el estado de la microbiota en el inicio del cáncer, el desarrollo del cáncer y la respuesta a varios agentes de quimioterapia y para evaluar la eficacia del tratamiento farmacológico. Este nuevo enfoque debería ayudar a desarrollar un enfoque terapéutico para limitar el efecto secundario de la quimioterapia.